K nejvýznamnějším toxickým peptidům patří termostabilní cyklické oligopeptidy vyskytující se v řadě druhů vyšších hub, zejména v rodu muchomůrka. Jejich jedovatost je dána tím, že narušují proteosyntézu a tím i kompletní fungování buněk. Postižena jsou především játra a ledviny.

Další toxické peptidy se vyskytují ve včelím jedu, v jedech hadů a štírů.